Med dvema volilnima konferencama uresničuje dogovorjene naloge glavni odbor. Število članov glavnega odbora določi letna konferenca. Njegovo delo vodi predsednik FIDES.
Skladno s Statutom predsednik lahko imenuje tudi praviloma dva podpredsednika.
Člani glavnega odbora v mandatnem obdobju 2023-2027:
- DRAŽEN ŽAGAR
- TATJANA CVETKO
- BORISLAV VRBANEC
- BORUT KOSTANJEVEC
- BOJAN KOSTIĆ
- ROK MEŽNAR
- MAJA LOGAR POLAJNAR
- ANDREJ RUPEL
- ANDREJA ČELOFIGA
- ROBERT KRALJ
- DIVNA BOGDANOVIĆ
- MATJAŽ KOPAČ
- ANITA MRVAR BREČKO
- GREGOR ZEMLJIČ
- NIKA AHAČIČ SREDNIK
- JURE KLANJŠČEK
- JANUSZ KLIM
- ALEŠ KLUN
- NATAŠA PODBREGAR
- BARBARA PROSEN
- ANA LINA VODUŠEK
- GORAN BUSER
- EVITA LESKOVŠEK
- BORIS RIŽNAR
- ALEKSANDAR BILIĆ (nadomestni član)
- ČRTOMIR SEUŠEK (nadomestni član)
