Med dvema volilnima konferencama uresničuje dogovorjene naloge glavni odbor. Število članov glavnega odbora določi letna konferenca. Njegovo delo vodi predsednik FIDES.
Skladno s Statutom predsednik lahko imenuje tudi dva podpredsednika.
Člani glavnega odbora v mandatnem obdobju 2019-2023:
- Ahačič Srednik Nika
- Babič Milan
- Bogdanovič Divna
- Čelofiga Andreja
- Drobnič Kovač Doroteja
- Kašnik Vasja
- Klim Janusz
- Kopač Matjaž
- Kostanjevec Borut
- Kostič Bojan
- Lazič Ivan
- Leskovšek Evita
- Mežnar Rok
- Mrvar Brečko Anita
- Podbregar Nataša
- Polh Damjan
- Rižnar Boris
- Rupel Andrej
- Saksida Silvan
- Selič Kurinčič Tanja
- Štagar Benjamin
- Trinkaus Leiler Darinka
- Vodušek Ana Lina
- Vrbanec Borislav
- Zemljič Gregor
- Žagar Dražen